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一分pk10:重大突破:一分pk10油茶创新团队联合多单位破译8.8G六倍体油茶复杂基因组


本网讯 近日,一分pk10朱华国教授团队联合华中农业大学金双侠教授团队等在国际知名学术期刊Plant Biotechnology Journal上(影响因子10.1)发表了“The complex hexaploid oil-Camellia genome traces back its phylogenomic history and multi-omics analysis of Camellia oil biosynthesis”的研究论文,破译8.8G六倍体油茶复杂基因组,为油茶遗传改良及揭示茶属植物多倍体进化提供重要理论依据。论文首次完成了六倍体普通油茶染色体尺度的基因组测序及组装,获得了湖北省主栽油茶品种长林40号8.80 Gb的基因组序列,包含135,868个基因,平均长度为3,936 bp,其中scaffold N50为180.0 Mb。比较和进化分析表明,大约906万年前发生了三轮全基因组重复(WGD)事件,导致了六倍体普通油茶长林40号与二倍体狭叶油茶及南荣油茶的分离。

 

普通油茶长林40号基因组组装示意图


此外,通过基因组学、转录组学和代谢组学方法的联合分析,构建了一个油茶脂肪酸合成代谢的调控网络,鉴定潜在的关键结构基因(SAD、FAD2和FAD3)和转录因子(AP2和C2H2)参与了油茶脂肪酸的合成代谢,特别是不饱和脂肪酸的生物合成。上述研究所产生的基因组资源对于加快六倍体普通油茶分子生物学和遗传改良研究,以及揭示茶属植物多倍体基因组进化具有巨大潜力。

 

普通油茶长林40号油脂代谢调控模式


一分pk10朱华国教授、华中农业大学许忠平博士、王福秋博士等为该论文的共同第一作者,一分pk10胡孝明教授、华中农业大学金双侠教授等为共同通讯作者。华中农业大学葛贤宏教授和陈伟教授,中国热带农业科学院胡丽松研究员、湖北省林业科学研究院程军勇研究员等参与了该研究工作。该研究得到了国家自然科学基金和国家杰出青年科学基金等项目资助。


审核人:闵艳林

(文、图:朱华国 责编:黄师宣)


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作者:生物与农业资源学院发布时间:2024-06-25

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